У S-Engineering впроваджено та діє автоматизована система онлайн управління проєктами Wrike. Усі виробничі департаменти S-Engineering працюють у Wrike. При цьому бухгалтерський та фінансовий облік, процеси логістики у S-Engineering ведуться у системі ERP. Крім того, у S-Engineering ведеться впровадження автоматизованої ERP-системи SAP Business One, яка об’єднає усі процеси компанії: виробництво, фінанси, управління персоналом, закупівлю, управління складами, логістику тощо.