S-Engineering hat ein automatisiertes Online-Projektmanagementsystem Wrike implementiert und betreibt es. Alle Fertigungsabteilungen von S-Engineering arbeiten bei Wrike. Gleichzeitig werden Buchhaltung und Finanzbuchhaltung sowie Logistikprozesse bei S-Engineering im System ERP abgewickelt. Darüber hinaus implementiert S-Engineering das automatisierte ERP-System SAP Business One, das alle Unternehmensprozesse vereinheitlichen wird: Fertigung, Finanzen, Personalverwaltung, Beschaffung, Lagerverwaltung, Logistik usw.